Một loạt các bất cập được Kiểm toán Nhà nước chỉ ra tại dự án BOT cầu Yên Lệnh. Lý giải những vấn đề trên, đại diện chủ đầu tư là công ty TNHH BOT cầu Yên Lệnh trả lời rằng do bộ Giao thông vận tải!?
Dù Tổng cục Đường bộ đề nghị giảm phí cho tất cả các xe qua trạm nhưng chủ đầu tư kiên quyết “lắc đầu”. Bên cạnh đó, dư luận còn đặt câu hỏi có hay không sự mập mờ trong việc thu phí ở trạm BOT này.
Mặc dù Bộ Tài chính khẳng định chưa cần thiết đầu tư nhưng Dự án đầu tư xây dựng Quốc lộ 38 đoạn từ Cầu Yên Lệnh đến nút giao Vực Vòng theo hình thức BOT vẫn được thực hiện để thu phí.